Ošetřovatelské perspektivy 2022, 5(1):13-25 | DOI: 10.25142/osp.2022.002

METODIKA KOLEKTIVNÍHO ANTIGENNÍHO SCREENINGU NA PŘÍTOMNOST VIRU SARS-COV-2

Iveta Bryjová1, Radka Stonišová2, Daniela Nedvědová1
1 Ústav nelékařských zdravotnických studií, Fakulta veřejných politik v Opavě, Slezská univerzita v Opavě
2 Oddělení patologické anatomie, Slezská nemocnice v Opavě

Východiska: Práce vychází z jednoho ze známých algoritmů kolektivního testování – metody skupinového testu sloučených vzorků – kterou experimentálně ověřujeme při povinném plošném screeningu pomocí POC antigenních testů v souvislosti s šířením nákazy COVID-19.

Cíl: Verifikovat metodu a stanovit doporučení pro skupinové testování na kvalitativní stanovení přítomnosti antigenu viru SARS-CoV-2 prostřednictvím POC antigenních testů v rámci celoplošného screeningu.

Metody: Experimentální pilotní studie s použitím POC testovacích sad pro kvalitativní detekci virových nukleoproteinových antigenů SARS-CoV-2 z přímých nazálních, nazofaryngeálních nebo orofaryngeálních výtěrů u vybrané populace doporučenou metodikou testování a metodikou kolektivního (skupinového)  testování.

Výsledky a diskuze: Porovnali jsme optimalizaci rozsahu kolektivně testované skupiny s citlivostí POC testovacích sad. Tato citlivost nedostačuje pro optimalizované rozsahy (okolo 10 vzorků) pro odhadovanou prevalenci mezi 1 % až 2 %, avšak citlivosti testovacích sad redukované optimální rozsahy (do pěti vzorků) nabízejí nezanedbatelnou úsporu.

Závěry: Navrhujeme testovací protokol kolektivního testování pětičlenných skupin, které za předpokladu 1 % až 2 % prevalence poskytují faktor úspory materiálu 0,25–0,3.

Klíčová slova: Antigenní test, senzitivita, specificita, screening, skupinové testování, COVID-19, SARS- CoV-2

METHODOLOGY OF A GROUP ANTIGENIC SCREENING FOR SARS-COV-2

Background: This paper is based  on  one  of  the  algorithms  of  collective  testing, the method of group screening, which we experimentally verify during mandatory screening using POC antigen tests in connection with the spread of COVID-19.

Aim: To verify the model and make recommendations for collective testing for qualitative determination of SARS-CoV-2 antigen detection by POC antigen tests in the context of  population-wide screening.

Methods: POC antigen test kits for the qualitative detection of SARS-CoV-2 viral nucleoprotein antigens from  direct  nasal,  nasopharyngeal,  or  oropharyngeal  swabs in a selected population using recommended testing and collective (group) testing methodologies.

Results and discussion: We compared the optimization of the size of the collectively tested group with the sensitivity of the POC test sets. This sensitivity is not sufficient for optimized size (around 10 samples) for an estimated prevalence between 1 % and 2 %, but even the size cut down by the test sensitivity (up to 5 samples) provides not negligible savings.

Conclusions: We propose a test protocol for collective testing of five-member groups, which, assuming a 1 % to 2 % prevalence, provide a material saving factor of 0,25–0.3.

Keywords: Antigen test, sensitivity, specificity, screening, group testing, COVID-19, SARS-CoV-2

Vloženo: 17. listopad 2021; Revidováno: 19. prosinec 2021; Přijato: 6. leden 2022; Zveřejněno: 9. červen 2022  Zobrazit citaci

ACS AIP APA ASA Harvard Chicago Chicago Notes IEEE ISO690 MLA NLM Turabian Vancouver
Bryjová I, Stonišová R, Nedvědová D. METODIKA KOLEKTIVNÍHO ANTIGENNÍHO SCREENINGU NA PŘÍTOMNOST VIRU SARS-COV-2. Ošetřovatelské perspektivy. 2022;5(1):13-25. doi: 10.25142/osp.2022.002.
Sdílet...
Stáhnout citaci
  • BibTeX (.bib)
  • Bookends (.ris)
  • EasyBib (.ris)
  • EndNote (.enw)
  • EndNote 8 (.xml)
  • ISI WoS (.isi)
  • Medlars (.medlars)
  • Mendeley (.ris)
  • MODS (.xml)
  • Papers (.ris)
  • RefWorks (.txt)
  • RefManager (.ris)
  • RIS (.ris)
  • MS Word (.xml)
  • Zotero (.ris)
    • Zobrazit celý článek

    Reference

    1. Aktualizované základní informace o onemocnění novým koronavirem - COVID-19 (coronavirus disease 2019). In: SZÚ [online]. 8. 7. 2020 [cit. 15. 11. 2021]. Dostupné z: https://bit.ly/3kIuOFI.
    2. BERNARD, M., COSENTINO, PIERI, L., ZACHARY, P., BUSER, M., KBAIER, L. a GIANNOLI, J.M. 2021. Retrospective analysis of the performance of the SARS-CoV-2 rapid antigen detection test compared to the reference RT-PCR test. Annales de Biologie Clinique [online]. 79(2), 168-175 [cit. 14. 3. 2022]. ISSN 0003-3898. Dostupné z: doi:10.1684/ abc.2021.1641. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    3. DINNES, J., DEEKS, J. J., BERHANE, S., et al. Rapid, point-of-care antigen and molecular- based tests for diagnosis of SARS-CoV-2 infection. Cochrane Database of Systematic Reviews. 2021, č. 4. ISSN 14651858. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    4. FERNANDEZ-MONTERO, A. et al. Validation of a rapid antigen test as a screening tool for SARS-CoV-2 infection in asymptomatic populations. Sensitivity, specificity and predictive values. EClinicalMedicine. 2021, roč. 37. ISSN 2589-5370. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    5. FERTÉ, T. et al. Accuracy of COVID-19 rapid antigenic tests compared to RT-PCR in a student population: The StudyCov study. Journal of Clinical Virology. 2021, roč. 141. ISSN 1386-6532. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    6. GENEST, C. and ROUSSEAU, C. Skupinový screening (Group Screening). Pokroky matematiky, fyziky a astronomie. 2021, roč. 66, č. 2, s.73-80. ISSN 0032-2423.
    7. Novel Coronavirus disease 2019 (COVID-19) Situation: Report - 42, 2021. World Health Organization: Coronavirus disease (COVID-19) [online]. May 2020 [cit. 14. 11. 2021]. Dostupné z: https://https://bit.ly/3CcxFww.
    8. Novel Coronavirus disease 2019 (COVID-19) Situation: Report - 5, 2020. World Health Organization: Coronavirus disease (COVID-19) [online]. 25. 1. 2020 [cit. 14. 11. 2021]. Dostupné z: https://bit.ly/3Dkr6cI.
    9. Novel Coronavirus (2019-nCoV): Situation Report - 8. World Health Organization: Coronavirus disease (COVID-19) [online]. 25. 1. 2020 [cit. 14. 11. 2021]. Dostupné z: https://bit.ly/3ounAX4.
    10. Novel Coronavirus (2019-nCoV): Situation Report - 11. World Health Organization: Coronavirus disease (COVID-19) [online]. 31. 1. 2020 [cit. 14. 11. 2021]. Dostupné z: https://bit.ly/3qIJJn4.
    11. RICE, J. A. Mathematical Statistics and Data Analysis. ‎Cengage Learning. 2006. ISBN 978-8131519547.
    12. SEYNAEVE, Y. et al. Evaluation of Two Rapid Antigenic Tests for the Detection of SARS- CoV-2 in Nasopharyngeal Swabs. Journal of Clinical Medicine. 2021, roč. 10, č. 13, s. 1-9. ISSN 2077-0383. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    13. TORRES, J. R. Are rapid antigen SARS-Cov-2 tests effective for mass screening of travelers at airports? The Olympic experience. Journal of Travel Medicine. 2021, roč. 28, č. 7. ISSN 1708-8305. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    14. TROJÁNEK, M. et al. Nový koronavirus (SARS-CoV-2) a onemocnění COVID-19. Časopis lékařů českých. 2020, roč. 159, č. 2, s. 55-66. ISSN 0008-7335. Přejít na PubMed...
    15. WEST, C. P., MONTORI, V. M. and SAMPATHKUMAR, P. COVID-19 Testing. Mayo Clinic Proceedings. 2021, roč. 95, č. 6, s. 1127-1129. ISSN 0025-6196. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    16. XU, M. et al. COVID‎19 diagnostic testing: Technology perspective. Clinical and Translational Medicine. 2020, roč. 10, č. 4, s. 1-15. ISSN 2001-1326. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    17. YOKOTA, I. et al. Mass Screening of Asymptomatic Persons for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Using Saliva. Clinical Infectious Diseases. 2021, roč. 73, č. 3, s. 559-565. ISSN 1058-4838. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
    18. ZAHROUNI, W. and KAMOUN, H. Group testing for large-scale COVID-19 screening. Journal of Decision Systems. 2021, s. 1-15. ISSN 1246-0125. Přejít k původnímu zdroji...

    Tento článek je publikován v režimu tzv. otevřeného přístupu k vědeckým informacím (Open Access), který je distribuován pod licencí Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0), která umožňuje distribuci, reprodukci a změny, pokud je původní dílo řádně ocitováno. Není povolena distribuce, reprodukce nebo změna, která není v souladu s podmínkami této licence.


    Zpět na obsah